Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vps4aQ8VEJ9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms