Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf4Q8VE97 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms