Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE80

Thoc3, THO complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc3Q8VE80 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thoc3Q8VE80 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Thoc3Q8VE80 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thoc3Q8VE80 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thoc3Q8VE80 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thoc3Q8VE80 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thoc3Q8VE80 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thoc3Q8VE80 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thoc3Q8VE80 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thoc3Q8VE80 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Thoc3Q8VE80 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Thoc3Q8VE80 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thoc3Q8VE80 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Thoc3Q8VE80 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thoc3Q8VE80 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Thoc3Q8VE80 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms