Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDN4

Ccdc92, Coiled-coil domain-containing protein 92, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc92Q8VDN4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc92Q8VDN4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms