Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms