Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Hecw1Q8K4P8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hecw1Q8K4P8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Hecw1Q8K4P8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hecw1Q8K4P8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hecw1Q8K4P8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Hecw1Q8K4P8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Hecw1Q8K4P8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hecw1Q8K4P8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hecw1Q8K4P8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hecw1Q8K4P8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hecw1Q8K4P8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hecw1Q8K4P8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Hecw1Q8K4P8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hecw1Q8K4P8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hecw1Q8K4P8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hecw1Q8K4P8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hecw1Q8K4P8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Hecw1Q8K4P8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hecw1Q8K4P8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hecw1Q8K4P8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hecw1Q8K4P8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hecw1Q8K4P8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hecw1Q8K4P8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hecw1Q8K4P8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hecw1Q8K4P8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Hecw1Q8K4P8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hecw1Q8K4P8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hecw1Q8K4P8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hecw1Q8K4P8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hecw1Q8K4P8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hecw1Q8K4P8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hecw1Q8K4P8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Hecw1Q8K4P8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hecw1Q8K4P8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms