Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28aQ8K3Y3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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