Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Ssh3Q8K330 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Ssh3Q8K330 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Ssh3Q8K330 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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