Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gtf3c1Q8K284 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c1Q8K284 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c1Q8K284 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c1Q8K284 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c1Q8K284 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c1Q8K284 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c1Q8K284 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c1Q8K284 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c1Q8K284 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms