Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Abcf3Q8K268 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Abcf3Q8K268 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Abcf3Q8K268 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Abcf3Q8K268 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Abcf3Q8K268 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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