Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sde2Q8K1J5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms