Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh2d5Q8JZW5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms