Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJC5

Neurl3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl3Q8CJC5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Neurl3Q8CJC5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Neurl3Q8CJC5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Neurl3Q8CJC5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Neurl3Q8CJC5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Neurl3Q8CJC5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms