Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TwnkQ8CIW5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms