Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CopaQ8CIE6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CopaQ8CIE6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CopaQ8CIE6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CopaQ8CIE6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CopaQ8CIE6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CopaQ8CIE6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CopaQ8CIE6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms