Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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