Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAI1

Ccdc142, Coiled-coil domain-containing protein 142, mousemouse

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Length 738 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc142Q8CAI1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc142Q8CAI1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc142Q8CAI1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc142Q8CAI1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc142Q8CAI1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc142Q8CAI1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc142Q8CAI1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc142Q8CAI1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc142Q8CAI1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc142Q8CAI1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc142Q8CAI1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc142Q8CAI1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc142Q8CAI1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc142Q8CAI1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc142Q8CAI1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc142Q8CAI1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc142Q8CAI1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc142Q8CAI1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc142Q8CAI1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc142Q8CAI1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc142Q8CAI1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc142Q8CAI1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc142Q8CAI1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms