Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Spef2Q8C9J3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spef2Q8C9J3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms