Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms