Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot2Q8C5L3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot2Q8C5L3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot2Q8C5L3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot2Q8C5L3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot2Q8C5L3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot2Q8C5L3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cnot2Q8C5L3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot2Q8C5L3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot2Q8C5L3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot2Q8C5L3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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