Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfrp1Q8C4U3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfrp1Q8C4U3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfrp1Q8C4U3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfrp1Q8C4U3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfrp1Q8C4U3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfrp1Q8C4U3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfrp1Q8C4U3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfrp1Q8C4U3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfrp1Q8C4U3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfrp1Q8C4U3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfrp1Q8C4U3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfrp1Q8C4U3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfrp1Q8C4U3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfrp1Q8C4U3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfrp1Q8C4U3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfrp1Q8C4U3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfrp1Q8C4U3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfrp1Q8C4U3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfrp1Q8C4U3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfrp1Q8C4U3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfrp1Q8C4U3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfrp1Q8C4U3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfrp1Q8C4U3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfrp1Q8C4U3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfrp1Q8C4U3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfrp1Q8C4U3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms