Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B1

Camsap2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camsap2Q8C1B1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Camsap2Q8C1B1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Camsap2Q8C1B1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Camsap2Q8C1B1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Camsap2Q8C1B1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Camsap2Q8C1B1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Camsap2Q8C1B1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Camsap2Q8C1B1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Camsap2Q8C1B1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Camsap2Q8C1B1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Camsap2Q8C1B1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Camsap2Q8C1B1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Camsap2Q8C1B1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Camsap2Q8C1B1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Camsap2Q8C1B1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Camsap2Q8C1B1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Camsap2Q8C1B1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Camsap2Q8C1B1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Camsap2Q8C1B1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Camsap2Q8C1B1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Camsap2Q8C1B1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Camsap2Q8C1B1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Camsap2Q8C1B1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Camsap2Q8C1B1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms