Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Cldn17Q8BXA6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Cldn17Q8BXA6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Cldn17Q8BXA6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Cldn17Q8BXA6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Cldn17Q8BXA6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Cldn17Q8BXA6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Cldn17Q8BXA6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Cldn17Q8BXA6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Cldn17Q8BXA6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Cldn17Q8BXA6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms