Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Usp38Q8BW70 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
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Usp38Q8BW70 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Usp38Q8BW70 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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Usp38Q8BW70 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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