Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp54Q8BL06 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp54Q8BL06 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms