Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy1Q8BIJ7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms