Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGT7

Smndc1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smndc1Q8BGT7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smndc1Q8BGT7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms