Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms