Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Amigo1Q80ZD8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms