Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Zbed4Q80WQ9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms