Protein–RNA interactions for Protein: Q80VU4

Ntf4, Neurotrophin-4, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf4Q80VU4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms