Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc1Q80VQ1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms