Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms