Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS58

Clec4b1, Antigen presenting cell lectin-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b1Q7TS58 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms