Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actn1Q7TPR4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms