Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ3

Shprh, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, mousemouse

Predictions only

Length 1,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShprhQ7TPQ3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ShprhQ7TPQ3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ShprhQ7TPQ3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ShprhQ7TPQ3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ShprhQ7TPQ3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ShprhQ7TPQ3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ShprhQ7TPQ3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ShprhQ7TPQ3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ShprhQ7TPQ3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ShprhQ7TPQ3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ShprhQ7TPQ3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ShprhQ7TPQ3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ShprhQ7TPQ3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ShprhQ7TPQ3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ShprhQ7TPQ3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ShprhQ7TPQ3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ShprhQ7TPQ3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ShprhQ7TPQ3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ShprhQ7TPQ3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ShprhQ7TPQ3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ShprhQ7TPQ3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ShprhQ7TPQ3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ShprhQ7TPQ3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ShprhQ7TPQ3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ShprhQ7TPQ3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ShprhQ7TPQ3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ShprhQ7TPQ3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ShprhQ7TPQ3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ShprhQ7TPQ3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ShprhQ7TPQ3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ShprhQ7TPQ3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ShprhQ7TPQ3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ShprhQ7TPQ3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ShprhQ7TPQ3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ShprhQ7TPQ3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ShprhQ7TPQ3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ShprhQ7TPQ3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ShprhQ7TPQ3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ShprhQ7TPQ3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ShprhQ7TPQ3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ShprhQ7TPQ3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ShprhQ7TPQ3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ShprhQ7TPQ3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms