Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmed3Q78IS1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmed3Q78IS1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms