Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SpopQ6ZWS8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms