Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Topbp1Q6ZQF0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms