Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms