Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Glis3Q6XP49 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Glis3Q6XP49 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Glis3Q6XP49 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Glis3Q6XP49 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Glis3Q6XP49 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Glis3Q6XP49 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Glis3Q6XP49 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Glis3Q6XP49 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Glis3Q6XP49 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Glis3Q6XP49 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Glis3Q6XP49 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Glis3Q6XP49 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Glis3Q6XP49 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Glis3Q6XP49 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Glis3Q6XP49 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Glis3Q6XP49 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Glis3Q6XP49 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Glis3Q6XP49 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Glis3Q6XP49 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Glis3Q6XP49 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Glis3Q6XP49 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Glis3Q6XP49 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Glis3Q6XP49 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Glis3Q6XP49 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms