Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc88cQ6VGS5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms