Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE3

Rrm2b, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 B, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrm2bQ6PEE3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rrm2bQ6PEE3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrm2bQ6PEE3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rrm2bQ6PEE3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms