Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85bQ6PDY0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms