Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mfsd13aQ6PDE8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms