Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Q4

Fhod1, FH1/FH2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhod1Q6P9Q4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fhod1Q6P9Q4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fhod1Q6P9Q4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Fhod1Q6P9Q4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fhod1Q6P9Q4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fhod1Q6P9Q4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fhod1Q6P9Q4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fhod1Q6P9Q4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fhod1Q6P9Q4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fhod1Q6P9Q4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fhod1Q6P9Q4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fhod1Q6P9Q4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fhod1Q6P9Q4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fhod1Q6P9Q4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fhod1Q6P9Q4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fhod1Q6P9Q4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fhod1Q6P9Q4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fhod1Q6P9Q4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fhod1Q6P9Q4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fhod1Q6P9Q4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Fhod1Q6P9Q4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fhod1Q6P9Q4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fhod1Q6P9Q4 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Fhod1Q6P9Q4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fhod1Q6P9Q4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fhod1Q6P9Q4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fhod1Q6P9Q4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fhod1Q6P9Q4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fhod1Q6P9Q4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fhod1Q6P9Q4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fhod1Q6P9Q4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fhod1Q6P9Q4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fhod1Q6P9Q4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fhod1Q6P9Q4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fhod1Q6P9Q4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fhod1Q6P9Q4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fhod1Q6P9Q4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fhod1Q6P9Q4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fhod1Q6P9Q4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fhod1Q6P9Q4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fhod1Q6P9Q4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fhod1Q6P9Q4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fhod1Q6P9Q4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms