Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp49Q6P9L4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp49Q6P9L4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
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Usp49Q6P9L4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp49Q6P9L4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp49Q6P9L4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp49Q6P9L4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Usp49Q6P9L4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp49Q6P9L4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp49Q6P9L4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Usp49Q6P9L4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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Usp49Q6P9L4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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Usp49Q6P9L4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp49Q6P9L4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Usp49Q6P9L4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Usp49Q6P9L4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Usp49Q6P9L4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Usp49Q6P9L4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Usp49Q6P9L4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Usp49Q6P9L4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Usp49Q6P9L4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Usp49Q6P9L4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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