Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3B9

Rbfa, Putative ribosome-binding factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbfaQ6P3B9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RbfaQ6P3B9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms