Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL8

Scube1, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube1Q6NZL8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scube1Q6NZL8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scube1Q6NZL8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scube1Q6NZL8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scube1Q6NZL8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scube1Q6NZL8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scube1Q6NZL8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scube1Q6NZL8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms