Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rprd2Q6NXI6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rprd2Q6NXI6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms